教育部國教署與 22 縣市政府合作，透過以下機制確保幼兒園收費透明與合規：
1. 經費補助：國教署每年補助各縣市政府稽查人力經費，確保有足夠人力進行查核。
2. 不定期稽查：地方政府會不定期派員至幼兒園進行實地檢查。
3. 帳務核對：稽查人員會依據家長提供的「繳費收據」，與園所報備給政府的系統資料進行比對。
4. 嚴格處分：一旦發現超收或不當收費，將要求限期改善並退還金額，同時依《幼兒教育及照顧法》處以 6 萬至 30 萬元罰鍰，並將違規紀錄公開於全國教保資訊網。
政府透過這些手段，確保家長選擇幼兒園時能更安心。
政府會透過補助、不定期稽查、帳務核對和嚴格處罰等方式，確保幼兒園收費合法，家長權益不受損。
政府稽查幼兒園收費的機制，主要仰賴教育部國教署撥給地方政府的人力經費補助，讓各縣市政府有資源進行查核。稽查方式包含不定期派員到幼兒園現場訪視，檢查教學環境、收費明細等是否符合規定。最關鍵的一環是帳務核對，稽查人員會比對家長繳費收據上的金額，與幼兒園向政府申報的收費標準系統資料，確保收費項目和金額都公開透明且合法。
實際操作上，家長最直接的權益保障就是手上的繳費收據。收到繳費通知或繳費後，務必仔細核對收據上的項目、金額是否與幼兒園事先公告的收費標準一致。如果發現有疑慮，例如收費項目不明、金額與公告不符，或是被要求額外繳交未事先說明的費用，都應該保留好相關單據，並在繳費後盡快向幼兒園提出詢問。如果幼兒園無法合理解釋，家長就可以向主管機關反映。
很多人會誤以為只要幼兒園有收費就是合法的，但其實幼兒園的收費項目和金額都必須經過政府的備查或核定。例如，學費、雜費、點心費、材料費等，都應該有明確的收費標準，並且公開張貼或提供給家長參考。有些額外的才藝班或課後活動費用，也必須是家長自由選擇參加，並另外收取合理費用，不能強迫家長繳交。
如果家長發現幼兒園有超收或不當收費的情況，可以向所在地的縣市政府教育局（處）提出檢舉。政府一旦查獲違規，會要求幼兒園限期改善並退還不當收取的費用，同時依《幼兒教育及照顧法》處以罰鍰，並將違規紀錄公布在全國教保資訊網，讓其他家長可以參考。若有疑問，也可直接撥打縣市政府教育局（處）的電話洽詢。